Причины эндометриоза пока остаются загадкой для науки и на данное время заболевание является одним из самых малоизученных. Согласно имеющимся на сегодняшний день данным возникновение заболевания связано с иммунными и гормональными патологическими нарушениями в организме, в результате которых происходит разрастание тканей эндометрия за пределами матки, некоторые специалисты выражают мнение об аутоиммунной этиологии болезни, но научных доказательств этого не существует.

До сих пор врачи не могут с точностью сказать, что является причиной, а что следствием развития полипов: гормональные сбои, воспалительные процессы женской половой сферы, нарушения функции яичников. С точностью можно сказать, что эти процессы неразрывно связаны между собою и часто друг друга сопровождают.